JYY valvoo opiskelijoiden etuja monella tasolla. Omassa yliopistossamme edunvalvontaa hoidetaan yhteistyössä opiskelijaedustajien, ainejärjestöjen ja yliopiston kanssa. JYYn kautta opiskelijat ovat edustettuina monissa yliopiston hallinnon toimielimissä ja työryhmissä. Hallinnon opiskelijaedustajat eli hallopedit ovat tavallisia opiskelijoita, jotka osallistuvat päätöksentekoon yliopistohallinnon eri tasoilla lakisääteisissä toimielimissä. Lisäksi opiskelijaedustajia on lukuisissa muissa toimielimissä.

Paikallisesti JYY valvoo opiskelijoiden etuja vaikuttamalla Jyväskylän kaupungin päätöksentekoon ja valtakunnallisesti yhteistyössä Suomen ylioppilaskuntien liiton (SYL) ja muiden ylioppilaskuntien kanssa. Opiskelijoiden Liikuntaliiton (OLL) jäsenyyden kautta JYY vaikuttaa niin kansallisella kuin kansainvälisilläkin kentillä opiskelijaliikunnan puolesta. Kansainväliseen opiskelijoiden edunvalvontaan osallistumme SYL:n ja Euroopan opiskelijoiden liiton (ESU) kautta.